Olyckan inträffade när 30-åringen reste hem till Kilgoris och han tappade kontrollen på sin suv då däcket gick sönder.
"Tack gode gud för livets gåva", skriver Rudisha på Twitter och bifogar en bild med sin svårt krockskadade bil.
"Jag mår bra, inga skador!".
Rudisha fördes till sjukhus för kontroll.
Löparstjärnan tog OS-guld både 2012 och 2016 och är tvåfaldig världsmästare på 800 meter. VM i Doha startar om en månad.